Проблемы производительности.
Хотя ReiserFS в общем, имеет преимущество в производительности над ext2, в частностях имеются и слабости. Первая - работа с "разреженными" файлами (например, mailbox). ReiserFS заметно хуже справляется с разреженными файлами, чем ext2. Положение должно изменится, когда разработчики Namesys вернуться к оптимизации этой стороны ReiserFS (предполагается в версии 4 ReiserFS). А сейчас ext2 - лучшее решение для приложений, которые помещают информацию в разреженные файлы.
Вы можете столкнуться с проблемами при написании кода, который делает связанный вызов stat() для большого числа файлов. Одно из приложений, которое имеет проблемы (проявляется только с ReiserFS на ядрах 2.4, но не с 2.2) - mutt mailer когда он читает большие maildir-style mailboxes. Очевидно, mutt выполняет вызов stats для каждого почтового файла дважды. Это имеет тенденцию замедления работы. В команде разработчиков ReiserFS об этой специфической проблеме знают и работают над ее устранением (решение будет включено в ReiserFS 4 или раньше).
